さて、ubuntu9.10へのバージョンアップは色々面倒らしいので、新規インストールを選択しました。
そこでハマったのがgrub2。結局今でも未解決ですが、とりあえずやったことを書きます。
最終的にパーティションは次のようにしました。

1. パーティション

sda
sda1（Windows7 Loader）
sda2（Windows7）
sda3（拡張領域）
sda5（ext4。とりあえず１００M。ただしどこにもマウントしない。）
sda6（ext4。/にマウント。）
sda7（swap）

2. インストール

なぜか、GRUB2がPBRにインストールできません。あるいはインストールできてもGRUB2が/boot以下を探せない？
MBRには以前から使っているMBMをインストールして、カーネルローダ（Windows LoaderとGRUB）を呼び出すことにしています。
ダメだったのは次のパターン。

・sda5を/にマウント。GRUBもsda5の先頭にインストール。
・sda5を/bootにマウント、sda6を/にマウント。sda5の先頭にGRUBをインストール。
・sda5を/にマウント、sda6を/bootにマウント。sda5の先頭にGRUBをインストール。

結局、sda5はext4でフォーマットするものの、どこにもマウントせずに空っぽのままとして、sda6に/以下全てをインストールしたところ無事に起動しました。ＧＲＵＢはsda5の先頭にインストールしてます。

ちなみに、LiveCDで起動してgrub-installを実行すると

grub-setup: warn: Attempting to install GRUB to a partition instead of the MBR. This is a BAD idea.
grub-setup: warn: Embedding is not possible. GRUB can only be installed in this setup by using blocklists. However, blocklists are UNRELIABLE and its use is discouraged.
grub-setup: error: If you really want blocklists, use –force.

となってダメ。オプション–forceを付けてもダメ。
さらに、インストールできたパターンでも、あとから/bootをリネームして、/etc/fstabを編集してsda5を/bootにマウントしたらダメ。（もちろん/bootの中身を全部、sda5にコピーしてからです。）
ただし、この時はMBMからGRUBのrescue起動までは進みました。
結局、/をインストールしたパーティションと/bootをインストールしたパーティションにはGRUB2のインストールができないのかな？

Ubuntu日本語フォーラムで苦労されていたのを参考にしました。